HBeAg-ve慢性感染患者的乙型肝炎X基因中与基因型相关的突变

StephenW

Sophisticated viral quasispecies with a genotype-related pattern of mutations in the hepatitis B X gene of HBeAg-ve chronically infected patients
Maria Francesca Cortese #  1   2 , Carolina González #  3 , Josep Gregori  4   5 , Rosario Casillas  4   3 , Luca Carioti  6 , Mercedes Guerrero-Murillo  7 , Mar Riveiro-Barciela  8   9 , Cristina Godoy  3   8 , Sara Sopena  4   3 , Marçal Yll  4   3 , Josep Quer  4   8 , Ariadna Rando  3 , Rosa Lopez-Martinez  3 , Beatriz Pacín Ruiz  4 , Selene García-García  4 , Rafael Esteban-Mur  8   9 , David Tabernero  3   8 , Maria Buti  8   9 , Francisco Rodríguez-Frías  3   8
Affiliations
Affiliations

    1
    Liver Unit, Liver Disease Laboratory-Viral Hepatitis, Vall d'Hebron Research Institute, Passeig Vall d'Hebrón, 119-129, Barcelona, Spain. [email protected].
    2
    Liver Pathology Unit, Departments of Biochemistry and Microbiology, Vall d'Hebron University Hospital and Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain. [email protected].
    3
    Liver Pathology Unit, Departments of Biochemistry and Microbiology, Vall d'Hebron University Hospital and Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.
    4
    Liver Unit, Liver Disease Laboratory-Viral Hepatitis, Vall d'Hebron Research Institute, Passeig Vall d'Hebrón, 119-129, Barcelona, Spain.
    5
    Roche Diagnostics SL, Sant Cugat del Vallès, Spain.
    6
    Department of Experimental Medicine, University of Rome Tor Vergata, Rome, Italy.
    7
    Department of Microbiology, Vall d'Hebron University Hospital, Barcelona, Spain.
    8
    Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Instituto De Salud Carlos III, Madrid, Spain.
    9
    Liver Unit, Department of Internal Medicine, Vall d'Hebron University Hospital and Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.

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Contributed equally.

    PMID: 33603102 DOI: 10.1038/s41598-021-83762-4

Abstract

Patients with HBeAg-negative chronic infection (CI) have not been extensively studied because of low viremia. The HBx protein, encoded by HBX, has a key role in viral replication. Here, we analyzed the viral quasispecies at the 5' end of HBX in CI patients and compared it with that of patients in other clinical stages. Fifty-eight HBeAg-negative patients were included: 16 CI, 19 chronic hepatitis B, 16 hepatocellular carcinoma and 6 liver cirrhosis. Quasispecies complexity and conservation were determined in the region between nucleotides 1255 and 1611. Amino acid changes detected were tested in vitro. CI patients showed higher complexity in terms of mutation frequency and nucleotide diversity and higher quasispecies conservation (p < 0.05). A genotype D-specific pattern of mutations (A12S/P33S/P46S/T36D-G) was identified in CI (median frequency, 81.7%), which determined a reduction in HBV DNA release of up to 1.5 log in vitro. CI patients showed a more complex and conserved viral quasispecies than the other groups. The genotype-specific pattern of mutations could partially explain the low viremia observed in these patients.

StephenW

HBeAg-ve慢性感染患者的乙型肝炎X基因中与基因型相关的突变型的复杂病毒准种
玛丽亚·弗朗西斯·科尔蒂斯（Maria Francesca Cortese）＃1 2，卡罗来纳州冈萨雷斯（CarolinaGonzález）＃3，何塞普·格雷戈里（Josep Gregori）4 5，罗萨里奥·卡西利亚斯（Rosario Casillas）4 3，卢卡·卡里奥蒂（Luca Carioti）6，梅赛德斯·格雷罗·穆里略（Mercer Guerrero-Murillo）7，马尔·里维罗·巴西埃拉（Mar Riveiro-Barciela）8 9，克里斯蒂娜·戈多（Cristina Godoy）3 8，萨拉·索潘塔（Sara Sopena）4 3，马尔萨尔（Marçal） Yll 4 3，Josep Quer 4 8，Ariadna Rando 3，Rosa Lopez-Martinez 3，BeatrizPacínRuiz 4，SeleneGarcía-García4，Rafael Esteban-Mur 8 9，David Tabernero 3 8，Maria Buti 8 9，FranciscoRodríguez-弗里亚斯3 8
隶属关系
隶属关系

    1个
    瓦尔德希伯伦研究所肝脏疾病实验室-病毒性肝炎肝脏科，西班牙巴塞罗那Passeig Vall d'Hebrón，119-129。 [email protected]。
    2
    瓦勒·德·希伯伦大学医院和西班牙巴塞罗那自治大学University ofAutònomade巴塞罗那生物化学和微生物学系肝脏病理科。 [email protected]。
    3
    瓦勒·德·希伯伦大学医院和西班牙巴塞罗那自治大学University ofAutònomade巴塞罗那生物化学和微生物学系肝脏病理科。
    4
    瓦尔德希伯伦研究所肝脏疾病实验室-病毒性肝炎肝脏科，西班牙巴塞罗那Passeig Vall d'Hebrón，119-129。
    5
    Roche Diagnostics SL，西班牙圣库加特·德尔瓦莱斯。
    6
    意大利罗马罗马韦尔加塔大学实验医学系。
    7
    西班牙巴塞罗那Vall d'Hebron大学医院微生物学系。
    8
    西班牙马德里萨洛德·卡洛斯三世研究所，西班牙生物医学研究中心（CIBERehd）。
    9
    瓦勒·德·希伯伦大学医院和西班牙巴塞罗那大学自治大学内科的肝脏科。

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贡献均等。

    PMID：33603102 DOI：10.1038 / s41598-021-83762-4

抽象的

由于病毒血症低，HBeAg阴性慢性感染（CI）患者尚未得到广泛研究。由HBX编码的HBx蛋白在病毒复制中起关键作用。在这里，我们分析了CI患者HBX 5'末端的病毒准种，并将其与其他临床阶段的患者进行了比较。包括58例HBeAg阴性患者：16例CI，19例慢性乙型肝炎，16例肝细胞癌和6例肝硬化。在核苷酸1255和1611之间的区域确定了准物种的复杂性和保守性。在体外测试了检测到的氨基酸变化。 CI患者在突变频率和核苷酸多样性以及更高的准种保存方面表现出更高的复杂性（p <0.05）。在CI（中位数频率为81.7％）中确定了D型基因型特异性突变模式（A12S / P33S / P46S / T36D-G），这确定了HBV DNA释放在体外最多减少1.5 log。 CI患者显示出比其他人群更为复杂和保守的病毒准种。突变的基因型特异性模式可以部分解释这些患者中观察到的低病毒血症。