乙型肝炎病毒(HBV)属嗜肝DNA病毒科嗜肝病毒素,它是已知的引起人类疾病的最小DNA病毒。HBV感染呈世界性分布,有血清学证据表明全世界约有20亿人曾经或持续感染乙肝病毒。1988年Okamoto首先提出了乙肝病毒基因分型法,近年来,随着分子生物技术的发展,人们对乙肝病毒基因型进行了大量研究。本文对乙型肝炎病毒基因型及临床方面研究进展综述如下 1 HBV基因型 1.1 HBV基因型概况 1988年Okamoto(1)从无症状携带者的血清中克隆出3株adw亚型的HBV DNA序列,比较它们的同源性,发现它们之间的差异为3.9% ~5.6%。而与美国的2株adw亚型的HBV DNA序列比较,发现它们之间的差异为8.3% ~9.3%。Okamoto根据不同基因型之间差异≥8% ,同基因型之间的同源性>92%为界限,将18株HBVDNA序列分为A、B、c、D 4种基因型,从而提出了基因型概念。Noxde等(2)对32例HBV患者S基因序列测序结果分析,发现了两个新的基因型E、F。Stuyvre等(3)在研究来自法国和美国的慢性乙肝患者血清标本时,发现了一个新的基因型G型。2002年Arauz Ruiz(4)对10株HBV进行全基因测序,发现其中3株虽与F型相近,但与F型又有明显不同。故命名为H型。根据HBV全基因核甘酸序列异源性8% ,或 S基因区核甘酸序列异源性4.2%,HBV基因型可分为A、B、C、D、E、F、G、H 8型。 1.2 HBV基因型分布在世界不同地区基因型分布不同,A型为全世界分布,B型、C型主要分布在亚洲,D型主要分布在美洲、南欧、澳大利亚和中东,E型主要分布在非洲,F型分布于美洲土著人和波利尼西亚,G型分布在美洲,H型在美国发现。在我国,许军等(5)对广东省廉江市284例慢性HBV感染者检测表明,基因型构成以c型和B型为主,两者分别为C型占73.2% ,B型占26.2% ,仅各有1例为D型和B、C混合型。在长江以南地区,以基因型B型为主占55% ,长江以北以C型为主占81.6% 。基因型C在全国各地均有流行,而E、F、G、H 4种基因型未发现。 1.3 HBV基因型分析方法 1.3.1 全基因序列测定根据HBY病毒核酸异源性≥8%进行分型 1.3.2 S基因序列测定Norder等(2)于1992年发现S基因序列的变化同全基因序列变化一致,从而简化了HBV DNA基因分析方法,同时发现了两个新的基因型E、F。且被全基因测序所证实。 1.3.3 聚合酶链反应一限制性酶长度多态性分析(PCR—RFCP):Lindn(6)建立了S基因的PCR—RFLP基因型分型方法,首次可区分A—F6种基因型。是目前常用的基因分析法。 1.3.4 单克隆抗体酶联免疫吸附测定(ELISA)法;Usuda等(7)制备前s2区域基因型特异性表位单克隆抗体,并用辣根过氧化物酶进行标记,该方法操作简单,适用于大规模的流行病学调查。 1.3.5 分子杂交法。 2 HBV基因型与血清型的关系及分布 根据HBV外膜蛋白第122~124位氨基酸(d/y决定族)第139~147位氨基酸(a决定族)以及第159~160位氨基酸(W/r决定族)的变化,将HBV分为adw、adr、ayw和ayr四个亚型,其中,W抗原决定族又可分为wl、W2 、W3 和w4。加上q决定族HBV可以分为9个血清型。不同的血清亚型可属于同一基因型,同一血清亚型又可分布于不同基因型。 3 HBV基因型与变异 3.1 基因型与1896位变异,前c区nt1896的变异,使前c区第28位氨基酸的UGG变为终止密码子UAG,即G—A突变,从而使前G区启动的编码终止,病毒无法表达HBeAg,在血清上表现为HBeAg阴性,但HBV DNA阳性,抗一HBe阳性。这一变异在B、C、D型中较常见,而A型少见。这是由于基因A型的1858位的c与1896位G配对,排拆该位点A的选择变异。相反,B、D、E和部分c型HBV 1858位的T,可与1896位的A变异配对,形成稳定的发卡结构。因此非A型特别是D型,前c区突变株较多L 。 3.2 基本核心启动子(BCP)AI726T和GI764A变异,被称为双突变。Orito等(10)发现双突变在基因型C中明显比B型多见,而与HBeAg或抗一HBe无关。 |