肝胆相照论坛

标题: BEAM的基于CRISPR技术的管线 [打印本页]
作者: tim889    时间: 2022-8-20 12:51     标题: BEAM的基于CRISPR技术的管线

本帖最后由 tim889 于 2022-9-19 18:04 编辑

https://investors.beamtx.com/news-releases/news-release-details/beam-therapeutics-announces-preclinical-data-highlighting
知道BEAM这样的公司对乙肝有兴趣，并且在开发基于David Liu发明的新型CRISPR系统的药物，令人看到彻底根除cccDNA和integrated HBV DNA 从而消灭乙肝的希望。虽然还在临床前阶段，还是令人振奋。

9月19日更新：

[size=18.200000762939453px]https://mp.weixin.qq.com/s/37km2_GgG5l7Uk2bkizzNw
作者: tim889    时间: 2022-8-20 12:52

如果ASO/RNAi不成功，CRISPR 和 adpotive T cell therapy 将是下一个10年的最大希望。
作者: lancas    时间: 2022-8-20 18:08

我觉着ASO/RNAi其实也不算成功了，但至少有可行性罢了
作者: sky8989    时间: 2022-8-20 19:00

这个属于彻底清除乙肝病毒
作者: tim889    时间: 2022-8-21 03:05

lancas 发表于 2022-8-20 02:08
我觉着ASO/RNAi其实也不算成功了，但至少有可行性罢了

CRISPR-based therapy 有一些临床了，主要是单基因疾病 比如 Sickle Cell Disease 和 β-Thalassemia
作者: tim889    时间: 2022-9-20 09:35

来，借N兄的中文微信链接更新一波 https://mp.weixin.qq.com/s/37km2_GgG5l7Uk2bkizzNw
作者: newchinabok    时间: 2022-9-20 09:45

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-20 09:50 编辑

我只能等眼前一拨药，下一拨，年青人等了，其码十年后了，太超前了，，太超前了，太超前了
作者: newchinabok    时间: 2022-9-20 19:51

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-20 19:52 编辑
tim889 发表于 2022-8-20 12:52
如果ASO/RNAi不成功，CRISPR 和 adpotive T cell therapy 将是下一个10年的最大希望。

aso成功无疑，这个编辑器也会成功，因为他们原理来自自然界，相信自然界，相信上帝的安排。相信全世界科学家的头脑，只不过要很久，很久才看到，十年以上吧
作者: tim889    时间: 2022-9-20 23:59

本帖最后由 tim889 于 2022-9-20 09:13 编辑
newchinabok 发表于 2022-9-20 03:51
aso成功无疑，这个编辑器也会成功，因为他们原理来自自然界，相信自然界，相信上帝的安排。相信全世界科学 ...

ASO/RNAi对个体来讲 是否能治愈还是有很大不确定性，得看运气。但是基因编辑没有这个问题。理想情况直接根治
作者: tim889    时间: 2022-9-21 00:00

本帖最后由 tim889 于 2022-9-20 08:00 编辑

基于基因编辑的治疗艾滋病的疗法进入一期临床： https://mp.weixin.qq.com/s/K1UFVtKiIl8qqCQZCP80Zw
作者: newchinabok    时间: 2022-9-21 02:37

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-21 07:31 编辑
tim889 发表于 2022-9-20 23:59
ASO/RNAi对个体来讲 是否能治愈还是有很大不确定性，得看运气。但是基因编辑没有这个问题。理想情况直接根 ...

以RNA为靶点的靶向药，主要有单链的反义寡核苷酸药物（ASO）、双链的RNA干扰药物（RNAi），现在才整明白gsk，vir是眼前一拨药的原理。
作者: newchinabok    时间: 2022-9-21 02:42

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-21 06:50 编辑

tim，我的真实生活中还没有你这高端的人士讲我知识之外的事，很新鲜。


作者: newchinabok    时间: 2022-9-21 02:42

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-21 02:45 编辑

tim，喜欢听你这位技术控谈新药，有点意思。谈sw老师语法问题也是热门话题，呵呵
作者: tim889    时间: 2022-9-21 09:36

做科研压力大，每天吃药吃的烦，等新药又不知道何年何月，论坛是吐槽和打发时间的好地方
作者: pppq123    时间: 2022-9-21 14:31

回复 tim889 的帖子

我和tim兄有点类似。
我也在做科研。但是没有TIM兄有高度。
每天嗑药挺烦的。
作者: newchinabok    时间: 2022-9-21 17:29

tim889 发表于 2022-9-21 09:36
做科研压力大，每天吃药吃的烦，等新药又不知道何年何月，论坛是吐槽和打发时间的好地方 ...

心情都是一样，大家都互相扶持向前走，gsk明年就会全球开展三期，符合条件就去试试
作者: StephenW    时间: 2022-9-21 19:17

tim889 发表于 2022-8-20 12:51
https://investors.beamtx.com/news-releases/news-release-details/beam-therapeutics-announces-preclini ...

"老鼠里都没有cccDNA，这种模型如果用来研究functional cure，看看笑笑就好了" - 还是令人振奋?

一切都是老鼠!

"这次所公布的数据是建立于之前的实验数据之上，即Beam所开发的胞嘧啶碱基编辑器，可在体外成功在乙肝病毒DNA中植入终止密码子，造成乙肝相关病毒生物标志物含量大幅下降（包含HBsAg、HBeAg、HBV DNA、3.5kb RNA）。基于这些发现，Beam进一步使用乙肝病毒小鼠模型，将1或2剂的胞嘧啶碱基编辑器通过脂质纳米微粒（LNP）送入小鼠体内，并以抗病毒药物entecavir作为对照组来检视治疗乙肝的疗效。"
作者: newchinabok    时间: 2022-9-21 20:53

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-21 20:54 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 19:17
"老鼠里都没有cccDNA，这种模型如果用来研究functional cure，看看笑笑就好了" - 还是令人振奋?

一切都 ...

sw老师，你和我们这批人可以看到目前这拨药上市，如gsk，vir，腾盛博药，歌礼的药，二三年的事，基因编辑就莫研究了，猴年马月
作者: StephenW    时间: 2022-9-21 21:00

https://beamtx.com/media/1rrjxj2o/hbvposter_2022_final.pdf
作者: tim889    时间: 2022-9-21 22:41

StephenW 发表于 2022-9-21 03:17
"老鼠里都没有cccDNA，这种模型如果用来研究functional cure，看看笑笑就好了" - 还是令人振奋?

一切都 ...

这肯定是humanized mouse了。
作者: tim889    时间: 2022-9-21 22:42

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 06:46 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 03:17
"老鼠里都没有cccDNA，这种模型如果用来研究functional cure，看看笑笑就好了" - 还是令人振奋?

一切都 ...

stephen 之前的paper横纵坐标看明白没？rep的binding assay找到了吗？咋都不回复咱们了呀？我还很期待看看binding assay呢
作者: StephenW    时间: 2022-9-22 00:32

tim889 发表于 2022-9-21 22:41
这肯定是humanized mouse了。

可悲的是humanized mouse没有整合的 hbv dna.
作者: StephenW    时间: 2022-9-22 00:44

回复 tim889 的帖子

"横纵坐标" 看明白没? - 怎么明白 -"transcription list neutralized by cccDNA" - 这是典型的伪科学.

"rep的binding assay" - 另一个伪科学例子.

胡说八道地使用科学术语是垃圾.
作者: tim889    时间: 2022-9-22 01:35

StephenW 发表于 2022-9-21 08:44
回复 tim889 的帖子

"横纵坐标" 看明白没? - 怎么明白 -"transcription list neutralized by cccDNA" - 这 ...

语无伦次了？binding assay是啥明白吗？哈哈哈
作者: tim889    时间: 2022-9-22 01:37

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 09:57 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 08:44
回复 tim889 的帖子

"横纵坐标" 看明白没? - 怎么明白 -"transcription list neutralized by cccDNA" - 这 ...

文科生吗？还是本科生化没学好？还是你那个年代连binding assay都没有？这倒是有可能的

早知道不问你了，连我在问啥都不懂。我跟你level真的差太远了。鸡同鸭讲。哈哈哈
作者: tim889    时间: 2022-9-22 01:37

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 09:39 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 08:44
回复 tim889 的帖子

"横纵坐标" 看明白没? - 怎么明白 -"transcription list neutralized by cccDNA" - 这 ...

一大把年纪还动不动骂人，对身体不好的。也不害臊吗？
作者: tim889    时间: 2022-9-22 01:41

StephenW 发表于 2022-9-21 08:44
回复 tim889 的帖子

"横纵坐标" 看明白没? - 怎么明白 -"transcription list neutralized by cccDNA" - 这 ...

看来你的确连paper原文都看不懂唉，横纵坐标都不知所云。看不懂不是你的错，跑来丢人显眼泼妇骂街就是你的不对了。
作者: StephenW    时间: 2022-9-22 02:10

tim889 发表于 2022-9-22 01:41
看来你的确连paper原文都看不懂唉，横纵坐标都不知所云。看不懂不是你的错，跑来丢人显眼泼妇骂街就是你 ...

"Grudda et al.的supplementary Figure 3中的transcription index已经是normalize by total cccDNA了"

transcription index 是 转录指数
横纵坐标 是 Horizontal and vertical coordinates

从"横纵坐标至"transcription index" 是因为你自己翻译"横纵坐标"作为"transcription index"!
对于一个声称在美国做了 20 年研究的人来说，这是一个愚蠢的错误. 说明你是骗子.
作者: tim889    时间: 2022-9-22 02:15

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 11:32 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 10:10
"Grudda et al.的supplementary Figure 3中的transcription index已经是normalize by total cccDNA了"

t ...

哈哈哈 是supplementary figure 6 啦 （sorry for the confusion~）。让你自己看paper，看了paper就不会不知道啥是 transcription index 了，可你就是不愿意看paper。你有这功夫跑来骂街，花点时间读读paper不好吗？
作者: tim889    时间: 2022-9-22 02:17

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 11:33 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 10:10
"Grudda et al.的supplementary Figure 3中的transcription index已经是normalize by total cccDNA了"

t ...

文章对定义写的很明白，你稍微认真读一下，就知道我在指什么。我跟你讲了这是normalize by cccDNA的了。
As these transcripts are almost exclusively a result of cccDNA transcription, we use this as a surrogate for cccDNA transcriptional activity, but conservatively designate the pgRNA/cccDNA molecular ratio as the pgRNA transcriptional index (pgRNA TI) (see Methods).

[attach]524942[/attach]


作者: tim889    时间: 2022-9-22 02:19

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 11:27 编辑

The pgRNA TI was calculated, as previously published, by dividing the number of pgRNA transcripts, measured by the 5′ HBV amplicon in RNA, by the number of cccDNA molecules, quantified by the mid-HBV assay in exonuclease I/III–treated DNA (
14,
15).
作者: tim889    时间: 2022-9-22 02:47

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 12:33 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 10:10
"Grudda et al.的supplementary Figure 3中的transcription index已经是normalize by total cccDNA了"

t ...

问你横纵坐标坐标是啥，你告诉我横纵坐标 是 Horizontal and vertical coordinates？！显示你强大的翻译能力？哈哈哈哈

你要是真读了paper，就理解我为啥说那篇commentary中的Marc Ghany和 Anna Lok的观点“多年 NA 治疗后 cccDNA 转录的下降可能是由于核衣壳循环减少和 cccDNA 的细胞内补充。不被这张图支持了。所以说赶紧去读读paper，丰富一下老年生活，不要动不动就跑论坛骂人


至于binding assay，劝你好好把现在的本科生的method in biochemistry读一读。你连binding assay是啥都不知道，我还是很震惊的。正常学过生化的本科生都应该至少知道基于co-IP, gel shift，FRET 以及 size exclusion chromatography之类的方法。我本来的确是想请教下你有没有binding assay，因为我对rep觉得有点好奇和怀疑，因为机理很不明确。但我现在知道你连基本的本科生的课程都没有掌握，以后跟你也没什么好讲，大家level的确差太远，你连我在讲啥都不知道。一天天的就会像泼妇骂街一样骂人是伪科学和骗子。除此之外真的一无是处。

虽然我不知道你学啥的，即便你学过biochem，你那个年代很多技术都没有，我猜FRET你可能都没有听说过吧，因为你那个年代估计连GFP都还没有。你不理解 也正常，但不学无术还要跑来骂街就出洋相了。




作者: tim889    时间: 2022-9-22 04:17

StephenW 发表于 2022-9-21 08:32
可悲的是humanized mouse没有整合的 hbv dna.


integrated DNA在cell line里面都有，为什么humanized mouse里面没有？只是frequency比较低罢了。

https://journals.asm.org/doi/full/10.1128/JVI.02007-17

作者: StephenW    时间: 2022-9-22 04:31

本帖最后由 StephenW 于 2022-9-22 04:32 编辑
tim889 发表于 2022-9-22 04:17
integrated DNA在cell line里面都有，为什么humanized mouse里面没有？只是frequency比较低罢了。

http ...

您参考论文的标题是:
Hepatitis B Virus DNA Integration Occurs Early in the Viral Life Cycle in an In Vitro Infection Model via Sodium Taurocholate Cotransporting Polypeptide-Dependent Uptake of Enveloped Virus Particles
乙型肝炎病毒 DNA 整合发生在 体外 感染模型的病毒生命周期早期，通过牛磺胆酸钠协同转运多肽依赖性摄取包膜病毒颗粒

体外不是在体内!

为什么humanized mouse里面没有？只是frequency比较低罢了- 仅代表您的个人意见.
作者: tim889    时间: 2022-9-22 04:38

StephenW 发表于 2022-9-21 12:31
您参考论文的标题是:
Hepatitis B Virus DNA Integration Occurs Early in the Viral Life Cycle in an In ...

如果你说humanized mouse里面没有integrated DNA，请拿出证据。

我感觉你分不清什么是“仅代表您的个人意见”和“educated guess”。humanized mouse使用的是human hepatocytes, 而DNA integration event仅发生在HBV infect 了host cell以后，并且现在学界的认识是random event，跟in vitro in vivo没有关系。没有任何理由怀疑在体外可以integrate，但体内就不行。我觉得你还是极度缺乏科学训练的。
作者: tim889    时间: 2022-9-22 04:41

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 12:52 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 12:31
您参考论文的标题是:
Hepatitis B Virus DNA Integration Occurs Early in the Viral Life Cycle in an In ...

老爷爷 我怀疑你不在澳洲哦 半夜四点不睡觉来泡论坛？哈哈哈
两点到四点持续发帖？他要么不是70多岁的老年人，要么不在澳洲。

StephenW是个骗子，需要被揭穿。
StephenW is a fraud. He needs to be umasked.
作者: StephenW    时间: 2022-9-22 04:49

tim889 发表于 2022-9-22 02:47
问你横纵坐标坐标是啥，你告诉我横纵坐标 是 Horizontal and vertical coordinates？！显示你强大的翻译能 ...

"问你横纵坐标坐标是啥" - "横纵坐标" 不是 "Horizontal and vertical coordinates", 那么一定是你自己的发明或垃圾.
作者: tim889    时间: 2022-9-22 04:54

StephenW 发表于 2022-9-21 12:49
"问你横纵坐标坐标是啥" - "横纵坐标" 不是 "Horizontal and vertical coordinates", 那么一定是你自己的 ...

阅读障碍 还是老年痴呆？哈哈哈哈。

我让你看看图片里的横纵坐标是啥，你来告诉我"横纵坐标" 是 "Horizontal and vertical coordinates"。智障么？笑死我了
作者: StephenW    时间: 2022-9-22 05:01

tim889 发表于 2022-9-22 04:54
阅读障碍 还是老年痴呆？哈哈哈哈。

我让你看看图片里的横纵坐标是啥，你来告诉我"横纵坐标" 是 "Horizo ...

Transcription Index 是转录指数, 不是 横纵坐标.
作者: tim889    时间: 2022-9-22 06:35

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 14:39 编辑
StephenW 发表于 2022-9-21 13:01
Transcription Index 是转录指数, 不是 横纵坐标.

我的妈呀。你能不能别来搞笑了。哈哈哈

Transcription Index 是纵坐标啦。图都给你贴出来了，自己看嘛。笑死我了 哈哈哈
作者: tim889    时间: 2022-9-22 06:51

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 15:05 编辑
newchinabok 发表于 2022-9-21 04:53
sw老师，你和我们这批人可以看到目前这拨药上市，如gsk，vir，腾盛博药，歌礼的药，二三年的事，基因编辑 ...

这论坛就是老爷爷命根子，是他老年生活的唯一精神支柱。你们在论坛说喜欢看我评论新药，他觉得他曾经的辉煌不在了，感到非常缺乏关注。于是心生嫉妒，就来找我麻烦了。

你们这样不好，在这个版发言要顾及一下这位缺爱的孤寡老人的感受。哈哈哈。 你看他这是一晚上没睡啊，这样搞下去老年人身体要垮掉的。
作者: 乙肝人1949    时间: 2022-9-22 12:35

（老太太）
作者: tim889    时间: 2022-9-22 12:51

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 21:36 编辑
乙肝人1949 发表于 2022-9-21 20:35
（老太太）

女用男名？哈哈哈 也有这个可能 比如变性人啥的，我们要政治正确，不能歧视LGBT。


当然根据他语无伦次的回复，更有可能像是你说的，是一只袋鼠
作者: newchinabok    时间: 2022-9-22 13:30

本帖最后由 newchinabok 于 2022-9-22 13:31 编辑

我觉得你们不对，病人都同病相怜，sw有这样那样不足，但我还挺他；大家齐努力，齐翻身吧
作者: tim889    时间: 2022-9-22 13:33

本帖最后由 tim889 于 2022-9-21 22:02 编辑
newchinabok 发表于 2022-9-21 21:30
我觉得你们不对，病人都同病相怜，sw有这样那样不足，但我还挺他；大家齐努力，齐翻身吧 ...

他23楼上来就骂我是垃圾，你不好好劝劝他？



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