分泌的乙型肝炎病毒剪接变体因 HBV 基因型和慢性乙型肝炎感

StephenW

分泌的乙型肝炎病毒剪接变体因 HBV 基因型和慢性乙型肝炎感染的不同阶段而异
奥利维亚·马斯拉克 1 2 ，约瑟夫·瓦格纳 1 ，维蒂娜·索齐 1 ，休·梅森 1 ，珍妮·斯瓦罗夫斯卡亚 3 ，苏珊娜·谭 3 ，阿努杰·加格 3 ，斯蒂芬·洛卡尼尼 1 ，莉莉·元 1 ，玛格丽特·利特尔约翰 1 4 ，彼得·雷维尔 1 2 4
隶属关系
隶属关系

    1
    澳大利亚维多利亚州彼得多尔蒂感染与免疫研究所皇家墨尔本医院维多利亚传染病参考实验室分子研究与开发部。
    2
    澳大利亚维多利亚州克莱顿莫纳什大学微生物学系。
    3
    吉利德科学公司，美国加利福尼亚州福斯特市。
    4
    澳大利亚维多利亚州帕克维尔墨尔本大学微生物学和免疫学系。

    PMID：35582878 DOI：10.1111/jvh.13702

抽象的

慢性乙型肝炎 (CHB) 的特征是经历了乙型肝炎病毒 (HBV) 感染和疾病的不同阶段。尽管 HBV 复制不是必需的，但越来越多的证据表明 HBV 剪接变异与肝病进展和发病机制有关。然而，迄今为止还没有关于不同 HBV 基因型在 CHB 各个阶段的剪接变异的频率或多样性的研究。使用内部生物信息学管道分析来自 CHB I、II 或 IV 期的 404 名 HBV 基因型 A、B、C 或 D 型患者样本的下一代测序数据，以确定 HBV 剪接变体。 HBV 剪接变异的频率和类型因基因型和自然史阶段而异。剪接变体 Sp1 是最常检测到的（206/404 51% 的患者），其次是 Sp13（151/404 37% 的患者）。变异的频率通常在 II 期最高（123/165 75% 的患者），该阶段通常与增强的免疫激活相关，其次是 I 期（69/99 70% 的患者）。在 Sp1 和 Sp13 的 II 期患者中，剪接变异与乙型肝炎 e 抗原 (HBeAg) 水平降低和实现 HBsAg 丧失（功能治愈）的可能性降低相关（分别为 p = 0.0014 和 0.0156）。患者血清中 HBV 剪接变异的频率因 HBV 基因型和慢性乙型肝炎自然病程阶段而显着不同。与复制性较高的 I 期相比，在 CHB II 期患者中检测到的 HBV 剪接变体水平增加尤其值得进一步研究。

关键词：慢性乙型肝炎；乙型肝炎表面抗原（HBsAg）；拼接。

本文受版权保护。版权所有。

StephenW

Secreted Hepatitis B virus splice variants differ by HBV genotype and across phases of chronic hepatitis B infection
Olivia Maslac  1   2 , Josef Wagner  1 , Vitina Sozzi  1 , Hugh Mason  1 , Jenny Svarovskaia  3 , Susanna Tan  3 , Anuj Gaggar  3 , Stephen Locarnini  1 , Lilly Yuen  1 , Margaret Littlejohn  1   4 , Peter A Revill  1   2   4
Affiliations
Affiliations

    1
    Division of Molecular Research and Development, Victorian Infectious Diseases Reference Laboratory, Royal Melbourne Hospital, at the Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, Victoria, Australia.
    2
    Department of Microbiology, Monash University, Clayton, Victoria, Australia.
    3
    Gilead Sciences, Foster City, California, USA.
    4
    Department of Microbiology and Immunology, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia.

    PMID: 35582878 DOI: 10.1111/jvh.13702

Abstract

Chronic hepatitis B (CHB) is characterized by progression through different phases of hepatitis B virus (HBV) infection and disease. Although not necessary for HBV replication, there is increasing evidence that HBV splice variants are associated with liver disease progression and pathogenesis. However there have been no studies to date on the frequency or diversity of splice variants for different HBV genotypes across the phases of CHB. Next generation sequencing data from 404 patient samples of HBV genotype A, B, C, or D in Phase I, Phase II or Phase IV of CHB was analysed for HBV splice variants using an in house bioinformatics pipeline. HBV splice variants differed in frequency and type by genotype and phase of natural history. Splice variant Sp1 was the most frequently detected (206/404 51% of patients), followed by Sp13 (151/404 37% of patients). The frequency of variants was generally highest in Phase II (123/165 75% of patients), a phase typically associated with enhanced immune activation, followed by Phase I (69/99 70% of patients). Splice variants were associated with reduced hepatitis B e antigen (HBeAg) levels and statistically reduced likelihood of achieving HBsAg loss (functional cure) in Phase II patients for Sp1 and Sp13 (p=0.0014 and 0.0156, respectively). The frequency of HBV splice variants in patient serum differed markedly by HBV genotype and phase of CHB natural history. The increased levels of HBV splice variants detected in CHB phase II patients compared to the higher replicative Phase I in particular warrants further investigation.

Keywords: Chronic Hepatitis B; hepatitis B surface antigen (HBsAg); splicing.

This article is protected by copyright. All rights reserved.

StephenW

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1111/jvh.13702