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输入蛋白β可以结合乙肝病毒核心蛋白及空芯状颗粒,诱导 [复制链接]

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发表于 2016-8-20 13:38 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
Importin β Can Bind Hepatitis B Virus Core Protein and Empty Core-Like Particles and Induce Structural Changes

    Chao Chen ,
    Joseph Che-Yen Wang ,
    Elizabeth E. Pierson,
    David Z. Keifer,
    Mildred Delaleau,
    Lara Gallucci,
    Christian Cazenave,
    Michael Kann,
    Martin F. Jarrold,
    Adam Zlotnick


PLOS x

    Published: August 12, 2016
    http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1005802

   
Chao Chen
    Contributed equally to this work with: Chao Chen, Joseph Che-Yen Wang
    Address Current address: Center for Biomedical Imaging, Medical University of South Carolina, Charleston, South Carolina, United States of America
    Affiliation Department of Molecular and Cellular Biochemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
Joseph Che-Yen Wang
    Contributed equally to this work with: Chao Chen, Joseph Che-Yen Wang
    Affiliation Department of Molecular and Cellular Biochemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
Elizabeth E. Pierson
    Address Current address: Department of Analytical Sciences, Merck Research Laboratories, Merck & Co., Inc., Rahway, New Jersey, United States of America
    Affiliation Department of Chemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
David Z. Keifer
    Affiliation Department of Chemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
Mildred Delaleau
    Address Current address: Institute for Research in Immunology and Cancer & Department of Pathology and Cell Biology, Université de Montréal, Montréal, QC, Canada
    Affiliations Universite de Bordeaux, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France
Lara Gallucci
    Affiliations Universite de Bordeaux, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France
Christian Cazenave
    Affiliations Universite de Bordeaux, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France
Michael Kann
    Affiliations Universite de Bordeaux, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, Bordeaux, France, CHU de Bordeaux, Bordeaux, France
Martin F. Jarrold
    Affiliation Department of Chemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
Adam Zlotnick
    * E-mail: [email protected]

    Affiliations Department of Molecular and Cellular Biochemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America, Department of Chemistry, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America, Department of Biology, Indiana University, Bloomington, Indiana, United States of America
Abstract

Hepatitis B virus (HBV) capsids are found in many forms: immature single-stranded RNA-filled cores, single-stranded DNA-filled replication intermediates, mature cores with relaxed circular double-stranded DNA, and empty capsids. A capsid, the protein shell of the core, is a complex of 240 copies of core protein. Mature cores are transported to the nucleus by a complex that includes both importin α and importin β (Impα and Impβ), which bind to the core protein’s C-terminal domains (CTDs). Here we have investigated the interactions of HBV core protein with importins in vitro. Strikingly, empty capsids and free core protein can bind Impβ without Impα. Cryo-EM image reconstructions show that the CTDs, which are located inside the capsid, can extrude through the capsid to be bound by Impβ. Impβ density localized on the capsid exterior near the quasi-sixfold vertices, suggested a maximum of 30 Impβ per capsid. However, examination of complexes using single molecule charge-detection mass spectrometry indicate that some complexes include over 90 Impβ molecules. Cryo-EM of capsids incubated with excess Impβ shows a population of damaged particles and a population of “dark” particles with internal density, suggesting that Impβ is effectively swallowed by the capsids, which implies that the capsids transiently open and close and can be destabilized by Impβ. Though the in vitro complexes with great excess of Impβ are not biological, these results have implications for trafficking of empty capsids and free core protein; activities that affect the basis of chronic HBV infection.
Author Summary

Viruses take advantage of host proteins. During infection, DNA-filled Hepatitis B Virus (HBV) cores are ferried to the nucleus by a complex of importin α and importin β; importinβ alone does not bind mature cores. However, a surprisingly large amount of the HBV core protein accumulates in nuclei. Here we show that both empty cores and free core protein can bind importin β alone. Using cryo-electron microscopy reconstructions we show that importin β associates with a putative importin β-binding motif, which is located on the interior of empty cores but can extrude through pores in the particle. Single-particle mass spectrometry, electron microscopy, and biochemical studies showed the importin β can destabilize empty particles. These results together demonstrate unsuspected interactions between the HBV core protein and the nuclear transport system. These interactions may have roles in regulating stability of empty capsids and transfer of HBV core protein to the nucleus.

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发表于 2016-8-20 13:38 |只看该作者
输入蛋白β可以结合乙肝病毒核心蛋白及空芯状颗粒,诱导结构的变化

    陈超,
    约瑟夫·鸿颜王,
    伊丽莎白E.皮尔逊,
    大卫Z.螨,
    米尔德里德Delaleau,
    拉拉加卢奇,
    基督教卡泽纳夫,
    迈克尔·卡恩,
    马丁F. Jarrold,
    亚当Zlotnick


PLOS点¯x

    发布时间:2016年8月12日
    http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1005802

   
陈超
    同等贡献这项工作有:陈超,约瑟夫·鸿王颜
    解决当前地址:南卡罗来纳医科大学中心生物医学成像,查尔斯顿,南卡罗来纳州,美国
    分子与细胞生物化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的从属关系部
约瑟夫·鸿王颜
    同等贡献这项工作有:陈超,约瑟夫·鸿王颜
    分子与细胞生物化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的从属关系部
伊丽莎白E.皮尔逊
    解决当前地址:分析科学系,默克研究实验室,默克制药公司,拉威,新泽西州,美国
    化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的从属关系部
大卫Z.螨
    化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的从属关系部
米尔德里德Delaleau
    解决当前地址:学院为研究免疫与癌症病理学和细胞生物学系,蒙特利尔大学,蒙特利尔,加拿大
    兼职Üniversite电波尔多,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国国家科学研究中心,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国
拉拉加卢奇
    兼职Üniversite电波尔多,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国国家科学研究中心,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国
基督教卡泽纳夫
    兼职Üniversite电波尔多,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国国家科学研究中心,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国
迈克尔·卡恩
    兼职Üniversite电波尔多,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国国家科学研究中心,Microbiologie Fondamentale等Pathogénicité,UMR 5234,波尔多,法国,CHU波尔多,波尔多,法国
马丁F. Jarrold
    化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的从属关系部
亚当Zlotnick
    *电子邮件:[email protected]

    分子与细胞生物化学,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国,化学系,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国,生物系,印地安那大学伯明顿分校,印第安纳州,美国的隶属关系部美国
抽象

未成熟的单链填充RNA的核,单链DNA填充复制中间体,具有松弛环状双链DNA成熟核心,和空衣壳:乙肝病毒(HBV)衣壳在许多形式中。衣壳,核心的蛋白质壳,是核心蛋白的240份的复合物。成熟核由包括两个输入蛋白α和输入蛋白β(Impα和Impβ),其结合到核心蛋白的C末端结构域(的CTD)的复合运送到细胞核。在这里,我们已经调查了HBV核心蛋白的相互作用在体外importins。引人注目的是,空衣壳和自由的核心蛋白可以绑定Impβ没有Impα。冷冻电镜图像重建表明的CTD,它们位于衣壳内,可以通过衣壳挤出到由Impβ约束。 Impβ密度定位于准六倍顶点附近的衣壳外,建议最多每30衣壳的Impβ。然而,使用单分子电荷检测质谱络合物的检查表明,一些络合物包括超过90Impβ分子。用过量Impβ孵育衣壳的冷冻电镜显示损坏颗粒群并用内部密度“暗”粒子群,这表明Impβ有效地被衣壳吞噬,这意味着该衣壳瞬时打开和关闭,并且可以不稳定通过Impβ。虽然在体外复合有很大的过剩Impβ都没有生物,这些结果对空衣壳和无核心蛋白贩卖影响;影响慢性HBV感染的基础活性。
笔者总结

病毒需要宿主蛋白的优势。期间感染,DNA的填充乙型肝炎病毒(HBV)芯摆渡到由输入蛋白α和输入蛋白β的复杂的核;单独importinβ不绑定成熟的核心。然而,令人惊奇地大量HBV核心蛋白的累积在细胞核。在这里,我们表明,无论是空的核心和自由的核心蛋白可以单独绑定输入蛋白β。使用低温电子显微镜重建,我们表明,输入蛋白β同伙与推定的输入蛋白β结合基序,其位于空芯的内部,但可以通过在颗粒的孔挤出。单粒子质谱,电镜,和生化研究表明,输入蛋白β能够破坏空粒子。这些结果一起表明HBV核心蛋白和核运输系统之间没有料到的相互作用。这些相互作​​用可有在调节空衣壳和HBV核心蛋白的转移至核的稳定性的作用。
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发表于 2016-8-20 13:39 |只看该作者

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发表于 2016-8-20 14:03 |只看该作者
令人惊奇地大量HBV核心蛋白的累积在细胞核…
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发表于 2016-8-20 15:33 |只看该作者
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"In an infection or HBV expression system, core protein is overexpressed with respect to the amount needed for virion formation. Some of the resulting empty capsids are secreted from the host cell. As much as 99% of enveloped cores are empty [1,60]. In most infected patients, most core protein is localized to the nucleus [32–34]. Most nuclear core protein is unlikely to be derived from infecting HBV since only a few virions are taken up and hepatocytes are resistant to new infections after infection is established on the cellular level. The interaction of empty cores with nuclear transport proteins has been an open question."
同意。学到新的东西. 核心蛋白可以用来调节病毒复制?HB X蛋白呢?

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发表于 2016-8-20 16:03 |只看该作者
StephenW 发表于 2016-8-20 15:33
回复 MP4 的帖子

"In an infection or HBV expression system, core protein is overexpressed with respe ...



记忆中X蛋白在原始病毒中是没有的
在我看E抗原,空壳蛋白,X蛋白都是对抗免疫的产物

http://www.bioon.com/3g/id/6680159/


Nature:重大突破!乙肝病毒利用蛋白X反击宿主自我防御!生物谷   2016/03/18

2016年3月18日/生物谷BIOON/--乙型肝炎病毒(HBV)的传染性比HIV高100倍。HBV主要是通过血液或其他体液传播。它感染肝细胞。慢性HBV感染能够导致诸如肝硬化和肝癌之类的严重健康问题。根据世界卫生组织(WHO)的统计,在全世界,慢性乙型肝炎影响将近2.4亿人,每年杀死将近80万人。已有药物用来治疗HBV,但是它们很少能够治愈这种感染,因此,在治疗结束后,这种病毒通常卷土重来。

在一项新的研究中,来自瑞士日内瓦大学、法国里昂大学和美国吉利德科技公司的研究人员发现我们的细胞如何自我抵御HBV感染,以及这种病毒如何反击。这项研究代表着我们对HBV的理解取得重要进展,并且提示着新的开发创新性治疗试剂方法。相关研究结果于2016年3月16日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Hepatitis B virus X protein identifies the Smc5/6 complex as a host restriction factor”。

病毒X蛋白破坏一种保护性宿主蛋白

我们的细胞产生大量的防御蛋白保护我们免受病毒感染。这些所谓的“限制因子”是抵抗病毒感染的第一道防线,组成先天性免疫反应的一个重要组分部分。然而,对我们的细胞如何自我抵抗HBV以及哪些限制因子参与其中(如果有的话),人们知之甚少。

当感染肝细胞后,HBV环形基因组到达细胞核,在那里,它仍然保持环状,而且独立于细胞染色体。但是随后发生什么呢?这就是日内瓦大学医学院微生物学家Michel Strubin教授所发现的。这项研究揭示出宿主蛋白复合体Smc5/6识别HBV基因组,随后作为一种限制因子阻止新的HBV病毒产生。

但是HBV知道如何自我防御。Michel Strubin解释道,“如果故事就这样结束,那么这种病毒就不再存在。它将不会依赖它的显著适应性。然而,实际上,这种病毒通过产生一种被称作X蛋白的小分子蛋白发起反击,X蛋白的功能就是破坏Smc5/6。它能够将这种限制因子带到肝细胞中起着垃圾桶作用的一部分,在那里把它清除掉。”随着Smc5/6消失,新的HBV病毒颗粒随后产生并感染附近的细胞。




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发表于 2016-8-20 19:12 |只看该作者
马克
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