EASL2015:突变基底核心定量测量 启动子区SUGGEST免疫耐受亏损

StephenW

O015
QUANTITATIVE MEASUREMENTS OF MUTATIONS IN BASAL CORE
PROMOTOR REGION SUGGEST A LOSS OF IMMUNE TOLERANCE
IN HBeAg POSITIVE CHRONIC HEPATITIS B INFECTIONS
G. Rosenberg1, J. Bayliss1, L. Yuen1, A. Gaggar2, K. Kitrinos2,
M. Subramanian2, E. Gane3, H.L. Chan4, R. Hammond1, S. Bowden1,
P. Revill1, S. Locarnini1, A. Thompson5. 1VIDRL, Melbourne, Australia;
2Gilead Sciences, Foster City, CA, United States; 3New Zealand
Transplant Unit, Auckland, New Zealand; 4The Chinese University of
Hong Kong, Hong Kong SAR, Hong Kong, China; 5St Vincent’s Hospital,
Melbourne, Australia
E-mail: [email protected]
Background and Aims: The standard clinical definition of immune
tolerant (IT) CHB includes HBeAg positivity, high HBVDNA, normal
ALT and minimal hepatic necroinflammation, assuming aBVHBV
predominantly wildtype HBV quasispecies under no immune
pressure. The GS-US-203-0101 trial evaluated TDF vs TDF+FTC
therapy in IT patients, and we previously identified the presence
of immune evasion mutations in a subset these patients using
population sequencing, suggesting that current clinical criteria need
updating. The aim of this study was to quantify immune evasion
mutations by Next Generation Sequencing (NGS) and evaluate their
impact at baseline and on-treatment.
Methods: Whole genome NGS was performed on baseline samples
(Illumina Miseq). A bioinformatics pipeline assembled validated
and mapped the sequencing data. This was analysed against
baseline demographic, clinical, and virological data, as well as ontreatment
outcomes after 192 weeks.
Results: Data were available for 99 patients (median age 32 yrs,
51% male, 95% Asian, genotype B/C 58%/42%; median ALT 25 IU/mL,
HBVDNA 8.5 log10 IU/mL, HBsAg 4.8 log10 IU/mL, HBeAg 3.6
log10PEIU/mL). NGS detected and quantified mutations present >1%,
including those at low frequency (<20%) that were not seen by
population sequencing (see Table 1).
The levels of BCP mutations fell into three categories, <1%, 1–5% and
>45%. Linear regression showed higher prevalence was associated
with older age (p = 0.001) and lower baseline HBsAg and HBeAg
titres (p < 0.001). A threshold of >1% BCP mutations at baseline
was analysed with respect to treatment outcomes alongside
previously identified parameters including treatment arm, baseline
serology and genotype. >1% BCP was independently associated
with improved viral suppression (89% vs 58%, OR= 12, p = 0.005)
and increased HBeAg decline (OR = 27, p = 0.004). Clinically relevant
thresholds for other mutations were investigated; core P130T >1%
negatively impacted on HBeAg decline (OR = 0.16, p = 0.02) and
NRE G1613A >5% negatively impacted viral suppression (OR = 0.24,
p = 0.02).
Table 1. Key mutations
                                                                   NGS                           Population
                                                                                                    sequencing
Negative Regulatory Element (NRE) G1613A    73 (74%)                    19 (19%)
Basal Core Promotor (BCP) 1762/1764             23 (23%)                    12 (12%)
BCP T/C1858G                                                0 (0%)                       0 (0%)
Precore (PC) G1896A                                     15 (15%)                      3 (3%)
Core P130T                                                  47 (47%)                       6 (6%)
PreS1 M1                                                     33 (33%)                       4 (4%)
PreS2 M1                                                     11 (11%)                      6 (6%)
HBsAg P120T/G145R                                      9 (9%)                         4 (4%)
RT 80/169/173/180/181/184/202/204/236/250 12 (12%)                      0 (0%)


Conclusions: BCP mutations are a virological response to host
immune pressure. An increased prevalence was associated with
lower HBeAg and HBsAg titres, improved viral suppression and
HBeAg decline on-treatment. These findings demonstrate baseline
heterogeneity within this immune tolerant population possibly
due to variability in immune pressure. Furthermore, these results
suggest that the current definition of IT may need to be updated to
include detection of BCP variants.

StephenW

O015
突变基底核心定量测量
启动子区SUGGEST免疫耐受亏损
治疗HBeAg阳性慢性乙型肝炎感染
G. Rosenberg1，J. Bayliss1，L. Yuen1，A Gaggar2，K. Kitrinos2，
M. Subramanian2，大肠杆菌Gane3，HL Chan4，R. Hammond1，S. Bowden1，
P. Revill1，S. Locarnini1，A Thompson5。 1VIDRL，墨尔本，澳大利亚;
2Gilead科学，福斯特市，加利福尼亚州，美国; 3New新西兰
移植科，奥克兰，新西兰;的4The中国大学
香港，香港特区，香港，中国; 5ST文森医院，
墨尔本，澳大利亚
电子信箱：[email protected]
背景和目的：免疫标准的临床定义
宽容（IT）乙肝大三阳，包括阳性，HBVDNA高，正常
ALT和最小的肝坏死性炎症，假设aBVHBV
在无免疫主要是野生型HBV准种
压力。该GS-US-203-0101试验评估TDF华盈VS FTC +
在治疗患者的IT，我们先前确定的存在
免疫逃避突变的一个子集，这些病人使用
人口测序，这表明当前的临床标准需要
更新。本研究的目的是为了量化免疫逃避
通过突变下一代测序（NGS）和评价其
在基线和在治疗的影响。
方法：NGS在基线样品进行全基因组
（Illumina公司Miseq）。生物信息学管道组装验证
并映射测序数据。这是针对分析
基线人口统计，临床和病毒学数据，以及ontreatment
192周后的结果。
结果：数据是可用的99例患者（平均年龄32岁，
51％的男性，95％为亚裔，基因型B / C 58％/ 42％;平均ALT 25 IU /毫升，
HBVDNA 8.5日志10 IU / mL时，乙肝表面抗原4.8日志10 IU / mL时，大三阳3.6
log10PEIU /毫升）。 NGS检测和定量突变目前> 1％，
包括在低频（<20％）的未看到
人口测序（见表1）。
BCP的突变水平分为三类，<1％，1-5％和
> 45％。回归分析显示发病率较高有关联
与年龄（p值= 0.001）和下基线HBsAg和HBeAg
滴度（P <0.001）。 > 1％BCP突变基线的阈
与分析方面的治疗成果一起
先前确定的参数，包括治疗组，基线
血清学和基因型。 > 1％BCP独立相关
具有改进的病毒抑制（89％对58％，或= 12，p值= 0.005）
并增加HBeAg的下降（OR = 27，P = 0.004）。临床相关
阈值其它突变进行了调查;核心P130T> 1％
对HBeAg下降（OR = 0.16，P = 0.02）和负面影响
NRE G1613A> 5％的负面影响抑制病毒（OR = 0.24，
P = 0.02）。
表1.关键基因突变
NGS人口
测序
负调节元件（NRE）G1613A 73（74％）19（19％）
基底核心启动子（BCP）1764分之176223（23％）12（12％）
BCP T / C1858G 0（0％）0（0％）
前C（PC），G1896A 15（15％）3（3％）
芯P130T 47（47％）6（6％）
前S1 M1 33（33％）4（4％）
前S2 M1 11（11％）6（6％）
的HBsAg P120T / G145R 9（9％）4（4％）
RT 80/169/173/180/181/184/202/204/236/250 12（12％）0（0％）
结论：BCP突变是病毒学应答举办
免疫压力。发病率增加与关联
较低的HBeAg和HBsAg的滴度，改进病毒抑制和
大三阳下降的处理。这些结果表明基线
这种免疫耐受人群中的异质性可能
由于变性免疫压力。此外，这些结果
表明，它的当前定义可能需要被更新，以
包括检测BCP变异。

yelanglms

楼主辛苦了！希望能用简单的话说明一下。

StephenW

回复 yelanglms 的帖子

能用简单的话说明一下? 研究并不总是黑或白色.

这项研究可能说明，为什么我们失去免疫耐受.

君看一叶舟

结论:BCP突变是宿主免疫压力的病毒学反映，e抗原和表面抗原定量越低，由于增加了对病毒的抑制，治疗中，提高了e抗原的下降率。这个研究表明免疫耐受人群中的基线异质性可能与多样性的免疫压力有关，进而，该研究表明，目前IT定义将被更新，应当增加BCP变异检测。

君看一叶舟

BCP将作为一种新措施，测试免疫耐受水平。