国际合作建成人类cDNA文库

天狼星

《科学此刻》 2004年4月15日

近日，遗传学家们得到了一种新的研究工具。一个由日本研究者带领的国际小组建立了一个带有注解的全长人类互补DNA（cDNA）文库，目前已向公众开放。这个数据库有望给那些与药物开发、基因捕获、分子进化，以及比较基因组学有关的研究带来福音。

CDNA是生物技术的基本工具。它是研究人员用一种名为逆转录酶的酶类合成的有机体DNA的实验室复制品--严格地说，它仅仅是编码蛋白质的那部分DNA。DNA转录为RNA，然后编辑制造出蛋白质。逆转录酶却走了一条相反的路径，由信使RNA制造基因。研究人员因此无需搜寻未编辑的基因组，也能制造出活性基因的复制品。

这个新文库是在6个主要的cDNA项目信息的基础上收集建立起来的，这6个项目包括：美国国家卫生研究院的哺乳动物基因收集计划、德国人类cDNA计划、上海的中国国家人类基因组中心的研究工作，以及3个日本项目。东京日本生物信息研究中心副主任Takashi Gojobori表示，参与各个项目的科学家们正在寻找使所有研究人员都能分享他们的工作，扩大单个收集工作价值的方法。他指出："一个项目无法涵盖全部内容，但是把它们合在一起，正好能够取长补短。"

这个文库包括20000多条唯一的cDNA序列数据，涵盖了已知与功能、结构、组织表达模式、疾病关系，以及普通实验动物的直向同源物等有关的各个方面。希望获得某个特定cDNA克隆拷贝的研究人员可以和适当的研究机构联系。另一个漫长的基因组注解项目于去年11月启动，已经得到了另外15000个克隆的数据，这些数据处理完毕将被加入文库中。该文库也可接受新提交的数据。对这些注解数据的分析已经使以往无法识别的数千个候选基因得以识别。

Gojobori将这个文库视为cDNA信息的基本储存库，并把它当作日本在该领域的主要贡献之一。日本很晚才开始参与人类基因组的排序工作，仅负责大约6%的排序任务。相反，3个日本项目负责了H-邀请数据库（H-Invitational Database）约60%的cDNA数据。他说："我想，日本研究人员希望为基因组工作做出一份独特的贡献。"