本贴将陆续贴出一些科普知识以及基础知识

天狼星

我想，我们在这里大部分，其实都只能是旁观者，跟踪者，或者被研究者，呵呵。不是研究者，所以我希望在保持内容的前沿性之外，能够将理解的门槛尽可能降低。以后我们会陆续在本贴贴出一些有关乙肝病毒和免疫学方面的基础知识，这些会对理解本版块文章有不少好处。[em12]

[此贴子已经被作者于2003-10-30 1:26:52编辑过]

medline

如何降低呢？

讨论版的话，来个每日一条小知识如何？

或每日一个新进展？

medline

或者也许，每日一学也比较好

格式

1： 我学到了什么？ 给出读书笔记。

2： 给出参考来源。

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每日一问也许也不错。

解答不难，难在提问。

好阳光

每日一问比较好。

问题好多。由我等无知小子来提问好了。
就怕问题太菜，让各位见笑。

天狼星

呵呵，老麦，每日一什么的恐怕时间是不行了。还是好阳光来每日一问好。哈哈。要坚持啊。

天狼星

现学现卖--------关于基因和HBV的基因知识（一）-->特深沉转移
中心法则：
蛋白质是怎样产生的：一基因编码一蛋白质（DNA到RNA到蛋白质，是有顺序的）；由于发现某些蛋白质由若干不同的多肽链构成，因此至少一基因一多肽还是成立的。

信使RNA（mRNA)
是DNA中核酸碱基有编码序列的一段精确的拷贝。该信息被翻译在专有细胞器上的独有的蛋白质分子，并呈现在所有细胞的细胞质中。肽链则用于连接蛋白质中的氨基酸。

PCR（Polymerase Chain Reaction)聚合酶链式反应，
其目的是人工复制DNA，需要3个条件：1.有充足的核苷酸碱基；2.要有引物，也就是一小端DNA（无论是人类、细菌或病毒，如果没有一小段核苷酸来引发，光靠DNA都不能气动复制DNA链）；3.有聚合酶。复制分3步骤1.分离DNA（separate);2.粘合引物(annealing)；3.复制(xeroxing)

重组技术
比如重组胰岛素，人类胰腺细胞在分离状态不容易生长，但基因设计导致细胞能够容易制造出胰岛素的前体，正向我们的身体所做的那样，然后用酶处理的方法去掉多肽就得到了重组的人类胰岛素。步骤：1.得到分离的基因；2.插入（易实现）；3.合成产品；4.产品的提纯；
其中的分离步骤，不是从大量的人类基因组中寻找（迄今为止仅有很少的基因被测序），而是通过基因表达。找到信使RNA分子，再从RNA反回到DNA，这违反中心法则，不过还好有逆转录病毒，它把人类的mRNA和逆转录病毒的聚合酶（逆转录酶）结合，从mRNA逆转录到DNA，从而得到分离出的DNA。
[说来这世界还真不可思议，对人还是对病毒都平，病毒可以利用人的细胞来复制，而人也可以利用细菌和病毒进行复制和传导]

质粒（plasmid），也是一小段DNA起到传运基因的作用。哪怕是从两种渊源差距很大的物种之间。有些病毒也可以起到相同的作用。一旦重组过的基因插入细菌后，包含有人类的互补基因（cDNA）的质粒就会增生。细菌就会产生数以百万计类似包含有人类基因的细胞。


心急火撩
---摘译自《科技英语选读：生物技术*环境科学》
[]为自己的评论

天狼星

现学现卖（二）---------揭穿UUUUUUUU的面目-->特深沉转移
关于核酸
1869年瑞士米舍尔从细胞分离出细胞核，细胞核被分离成2种物质：蛋白质、另一种具有强酸性，被命名为核酸。核酸易被降解，在最终产物中发现富含氮的4种物质：鸟嘌呤G（guanine)、腺嘌呤A（adenine）、胸腺嘧啶T（thymine）、胞嘧啶C（cytosine），另外还有一些具有糖性质的物质和磷酸。其中单糖、每种嘌呤或嘧啶碱基、磷酸的摩尔量比为1：1：1。
1911年莱文证明核酸所含的糖由5个碳原子组成，命名为核糖。核糖分两种RNA与DNA。RNA中没有胸腺嘧啶，取代它的是新的嘧啶－－－尿嘧啶U。

DNA是遗传物质。因为自然界中所有的DNA分子中的糖－磷酸骨架都一样，所有碱基都一样，唯一不同的是构成DNA碱基的顺序不同。所以推测DNA是遗传物质的信息体现在核苷酸的顺序。氨基酸有20种，每连续3个核苷酸组成1个氨基酸密码子。从DNA转录到RNA再翻译到蛋白质，信息是一个密码子一个密码子读的，是有方向的从5'到3'（从上游到下游）

揭开UUUUUUUU的真面目，他是由尿嘧啶核苷酸组成的多核苷酸链
遗传密码表
UUU苯丙氨酸 UCU丝氨酸 UAU酪氨酸 UGU半胱氨酸
UUC苯丙氨酸 UCC丝氨酸 UAC酪氨酸 UGC半胱氨酸
UUA亮氨酸 UCA丝氨酸 UAA终止 UGA终止
UUG亮氨酸 UCG丝氨酸 UAG终止 UGG色氨酸

CUU亮氨酸 CCU脯氨酸 CAU组氨酸 CGU精氨酸
CUC亮氨酸 CCC脯氨酸 CAC组氨酸 CGC精氨酸
CUA亮氨酸 CCA脯氨酸 CAA谷氨酰胺 CGA精氨酸
CUG亮氨酸 CCG脯氨酸 CAG谷氨酰胺 CGG精氨酸

AUU易亮氨酸 ACU苏氨酸 AAU天冬氨酸 AGU丝氨酸
AUC易亮氨酸 ACC苏氨酸 AAC天冬酰胺 AGC丝氨酸
AUA易亮氨酸 ACA苏氨酸 AAA赖氨酸 AGA精氨酸
AUG甲硫氨酸 ACG苏氨酸 AAG赖氨酸 AGG精氨酸
起始

GUU缬氨酸 GCU丙氨酸 GAU天冬氨酸 GGU甘氨酸
GUC缬氨酸 GCC丙氨酸 GAC天冬氨酸 GGC甘氨酸
GUA缬氨酸 GCA丙氨酸 GAA谷氨酸 GGA甘氨酸
GUG缬氨酸 GCG丙氨酸 GAG谷氨酸 GGG甘氨酸

只有色氨酸、甲硫氨酸为一种密码子编码的氨基酸，其它均由两种以上编码。密码子是通用的，从病毒、原核细胞到真核细胞，都用同样的方法。密码子不重叠，无标点，从5'到3'一个一个读。


1978年吉尔伯特提出内含子（intron）和外含子（exon）概念。外含子指能编码蛋白质的密码子组，内含子是不编码任何蛋白质的密码组。DNA先精密复制到前体RNA（hnRNA),再修饰加工（内含子自切），形成只有外含子的mRNA
现学现卖（三）－－－－关于分型和调控元件
RNA分4种：mRNA、tRNA、rRNA(核糖体RNA)、snRNA(小核RNA)
HBV基因组有开放阅读区S、C、X、P。表面抗元中S基因编码小蛋白，S和S2共同编码中蛋白，S、S2和S1共同编码大蛋白。3.2kb的HBVDNA转录至少4种mRNA:3.5kb(有2种）、2.4kb的mRNA、2.1kb的mRNA、0.7kb的mRNA；4种mRNA的转录分别受各区的启动子的调控，而各区启动子的调控又受2种增强子，1种静止子的调控。另外还有多种cis活性因子区，有：S基因内的糖皮质应答元件（GRE）；C基因上游的负性调节元件（NRE1611－1634nt）；肝细胞核因子结合位点；SPl结合位点；C基因中的转录终止信号；增强子1区新发现的干扰素刺激调节成分样区（ISRE）

HBV的血清分型（9种）和基因分型（7种）的关系：
A（adw2、ayw1）
B（adw2、ayw1）
C（adr、ayr、adw2）
D（ayw2、ayw3）
E（ayw4）
F（adw4、ayw4）
G（adw2）

血型中决定a的是各型共有的，d、y型由HBsAg的第122密码子是赖氨酸或是精氨酸决定，w、r亚型是则由第160位密码子是由氨基酸或精氨酸决定的。

非专业人士，仅供参考

天狼星

学现卖（四 ）-----------------关于免疫
由于现有的抗病毒药物不能有效清除HBV病毒，而一些幸运的慢性HBV患者及急性患者的自愈都是自身体内的免疫系统能够有效地杀灭病毒，因此免疫法治疗的方法和意义应该了解一下。现在国内免疫疗法很多，从大多数的中药疗法，到现有疫苗的3联疗法，从金医生的LAK（＋APC）疗法到我比较关注的治疗性疫苗的疗法。都属于免疫疗法。

人体的免疫分体液免疫和细胞免疫。
前者主要是指淋巴B细胞针对特异性抗原所释放出来的抗体，抗体则主要用来中和病毒及其蛋白。
后者主要是指淋巴T细胞，用来消灭被感染的病毒。现在的免疫疗法主要是激发T细胞的功能。
另外还有自然杀伤细胞NK，主要是对付非特异的异物侵犯，也同时协调B细胞和T细胞共同防御机体。

B细胞来自骨髓，（我想可能也来自脾等器官）；T细胞来自于骨髓的前体T细胞，胸腺是其发育和成熟的地方，T细胞在外周血中的生命有几十年。

T-B细胞协同作用的分子基础是T细胞和B细胞分别识别同一抗原分子上的不同抗原决定簇（表位），T细胞识别T细胞表位，B细胞识别B细胞表位。细胞免疫和体液免疫在功能上既有分工有相互协作。

免疫细胞膜表达的分子可分为三类：1 与抗原识别有关的分子；2 与信号传导有关的分子；3 细胞表面黏附分子。细胞膜蛋白分子是细胞的一种接触性“语言”，而细胞因子则是非接触性短距离对话。


上述的淋巴细胞功能的正常运作也需要各种细胞因子的参与。细胞因子就是一些人体各器官分泌出的蛋白分子。如白细胞介素（IL），干扰素（IFN），肿瘤坏死因子（TNF),集落刺激因子（CSF），趋化因子等。
它们之间的信号传导和网络相当复杂。

白细胞介素的名称是1979年确定的，是单核巨噬细胞、T细胞分泌的某些非特异性发挥免疫调节和在炎症中起作用的因子。

细胞因子，1974年创立：通过自分泌或旁分泌方式发挥其生物学作用。细胞因子通过与靶细胞表面的相应受体的相互作用，将生物信号传导至细胞内。

细胞因子主要作用于白细胞。
生长因子主要作用于其它类型的体细胞。


补体，补体存在于正常血清中，是具有酶活性的球蛋白。它构成非特异性免疫的重要成分，又是联结体液免疫和细胞免疫，特异性免疫和非特异性免疫的重要环节。现知补体有九段十一种，C1－9，其中C1又可分为C1q、C1r、C1s。这11种补体成分大多数属于贝它球蛋白；少数属于尔而法球蛋白；都是大分子物质。一般说，要有抗原抗体复合物才能结合补体。因此，测定血清补体，有助体内存在免疫复合物的判断。


免疫应答基因与主要组织相容性复合体
不同人对于外来抗原侵犯所显示出来的免疫应答是不同的，比如有的人会对某种蛋白肽有反应，而其他人可能对另外一种蛋白肽有反应，这反应出来的就是应答基因的不同。从小鼠到人类，已发现有30多种不同的免疫应答基因。身体在产生抵御外来异物抗原时，有时需要T细胞的参与，有时并不需要。而免疫应答基因（Ir）只对需要有T细胞参与生成抗体的那部分起作用。
那些影响移植器官存活的基因被命名为“组织相容性基因”其中一个位点比较重要，即H-2，而这个位点是一个3位点的复合体。所有的脊椎动物都有这样的主要组织相容性复合体。


抗体的多样性。
对应外界入侵的分子（抗原）时，体内总会产生一种专一性很强的蛋白质即抗体来对抗。而这就产生令人疑惑的问题：外界分子的变化是不休的，而基因却是相对稳定的。那稳定的基因是如何产生可变的抗体来对付多样的抗原呢？抗体是由B细胞产生的。原始B细胞是由干细胞分化而来，在这个过程中发生基因重排；而后在受到不同抗原的刺激下原始B细胞发生初级应答，向淋巴细胞分化，并趋于成熟，这个过程中发生RNA剪接及多肽链加工；另外原始B细胞也发生体细胞突变，并在抗原刺激下产生次级应答，从而形成另一种淋巴细胞。

天狼星

现学现卖（五）---------HBV相关免疫
下面是一些针对HBV的现代的有关免疫的研究。

T细胞受到某些因素刺激后分化为成熟的专职T细胞。现在理论分为Th0，Th1，Th2，Th3几个亚群；其中Th0是前体细胞，Th1和Th2是有它分化而来的。
现在认为Th1主要分泌IL-2（白细胞介素2）、IL12、IL18、IFN－嘎嘛、TNF杯他等1型细胞因子通过促进NK、CTL、及巨嗜细胞活化、增值，介导细胞毒效应杀死病毒。
Th2主要分泌IL4、5、6、10、13等2型细胞因子刺激B细胞增值，产生增值，参与体液免疫。


HBv可能通过其合成的病毒蛋白，使人体淋巴细胞的调亡，可能造成HBV的持续感染。

有研究表明CHB患者体内主导的是Th2应答，而Th1应答较弱。

对于拉米夫定治疗完全应答的人来说，其Th1细胞应答增强，Th2细胞应答减弱。

对于干扰素治疗完全应答的人来说也有这样的现象。

如果体内的HBV DNA含量较高，则病毒对产生IFN嘎嘛的协同效应有抑制作用。（病毒在干扰）

HBV病毒可通过抑制患者DC（树突细胞。一种APC即抗原呈递细胞）表面的刺激分子的表达，从而使抗原呈递功能降低。

T细胞的双信号识别特性。即不单要有第一信号（病毒产生的抗原），而且还要由DC等抗原呈递细胞将抗原处理成多肽后的第二信号的刺激才能识别。而患者的持续感染主要是第二信号传导出现问题。而持续的只有第一信号的刺激会导致免疫耐受，或程序死亡。

天狼星

有时间我将病毒学里面关于乙肝病毒内容转移上来。